MySQL Workbenchを使ってスキーマの差分をとってALTER文を生成

MySQL Workbench 6.0を使います

1.File -> New Model (Command+N)

2.Database -> Synchronize With Any Source

Modelをちゃんと作っていれば、Synchronize Modelでも行けるはず

Select Database

一番上が更新したい新しいDB、下が元の古いDBを入力
Send Updates To は ALTER Script Fileにする

あとは、画面に表示される内容をみて選んでいけばALTER Script Fileが生成されます
簡単ですね〜